העימות בין שר הביטחון לרמטכ"ל פרץ לאחר ששר הביטחון הודיע כי דיון שיבוצי הקצינים שקיים הרמטכ"ל נערך בניגוד להנחייתו וללא תיאום מוקדם. כ"ץ אף הבהיר כי אין בכוונתו לדון בשמות שנקבעו או לאשרם, ובכך שיגר מסר חד כי אינו מהווה "חותמת גומי" להחלטות הרמטכ"ל.

המתיחות התפרצה על רקע שתי מחלוקות מרכזיות: האחת – אי־הסכמה סביב מינוי אלופים במטה הכללי, רשימה רגישה שבין אנשיה צפויים לצמוח מפקדי הצבא הבכירים בשנים הקרובות; השנייה – חילוקי דעות על דרכי הפעולה ברצועת עזה, ובעיקר לאחר שהקבינט דחה את הצעת זמיר להמשך הלחימה והורה על השתלטות על העיר עזה עד 7 באוקטובר.