אתר מורשת לאומי גבעת התחמושת החל בפרויקט ייחודי לאיתור שמותיהם של האזרחים החללים ממלחמת ששת הימים. עד כה אותרו חמש משפחות של חללים, מתוך כ-20 אזרחים, אשר ידוע שנהרגו במלחמה. 

"הניצחון הצבאי המהיר והמהדהד של מלחמת ששת הימים, הותיר את הזיכרון הקולקטיבי ממוקד בגבורה בשדה הקרב, אך מתחת לפני השטח הסתתר גם כאב אזרחי – קורבנות חפים מפשע ששמם וסיפורם כמעט לא זכה להכרה. המלחמה הנוכחית חידדה את החשיבות של הסיפור האזרחי כחלק מתמונה אחת שלמה בתיעוד וזיכרון המלחמה ולכן החלטנו להקים את פרויקט הנצחת האזרחים של מלחמת ששת הימים". מסביר כתרי מעוז, מנכ"ל גבעת התחמושת.  

משפחתו של ניסים ונונו ז"ל, היא אחת מהמשפחות שאותרו במסגרת הפרויקט. ניסים ונונו נהרג מהפגזה של הירדנים על כפר סבא, ביומה הראשון של המלחמה, בעת שעבד במפעל אלבר. פני ונונו, בתו מספרת: "עד היום הציבור הכיר רק את השמות והסיפורים של החיילים שנהרגו בקרבות המלחמה ורבים לא יודעים על האבדות בעורף. מרגש אותי מאוד לספר את סיפור חייו ומותו של אבי, 58 שנים אחרי המלחמה, למען הנצחת שמו וסיפורו כחלק מהסיפור של מלחמת ששת הימים. עד היום סיפורו של אבי היה ידוע רק במשפחה, כעת הוא יהיה חלק מסיפור ששת הימים וגלוי לציבור הרחב". 

עד כה הצליחו במרכז מורשת לאומי גבעת התחמושת להגיע לחמש משפחות של אזרחים שנהרגו במלחמה, בניהן גם משפחתו של הנער אברהם איפרגן, שנהרג יחד עם חברו יצחק (ז׳קו) מנסור מפגיעת פגז ירדני שנורה לעבר שכונת גבעת מרדכי בירושלים. הפגז פגע בסמוך לבית הכנסת השכונתי, שבו נהג אביו של אברהם להתפלל". 

נפתלי אחיו הצעיר של אברהם שיתף את אנשי גבעת התחמושת: "הוא היה האח ששמר עלינו. ביום המלחמה הוא לבש את החולצה עם הפרחים הקטנים – זה תקוע לי בזיכרון. אמא ביקשה שלא יצא, והוא אמר: 'אני רק הולך רגע וחוזר'. הוא לא חזר".

בנוסף, אותרה גם משפחתו של הנער חיים גרון שביחד עם כלבו הנאמן דץ, רצו יחדיו לחבור לכוחות הלוחמים ברצועת עזה במלחמת ששת הימים. במהלך הניסון לחבור לכוחות, נרצח חיים באכזריות על ידי כמה מתושבי מחנה הפליטים בדיר אל-באלח, הכלב חזר לבדו לגבול ישראל. גופתו השרופה של חיים אותרה רק כעבור ארבעה חודשים. 

"בשלב זה הצלחנו לאתר חמש משפחות של חללים אזרחיים – וסיפוריהם המרגשים מעידים על הפנים של האובדן האזרחי במלחמה.אנחנו מאמינים שיש עוד משפחות רבות של חללים שהסיפור שלהן לא סופר – ואנו זקוקים לעזרת הציבור כדי להשלים את התמונה", ציינו עוד באתר.