השר לביטחון לאומי, איתמר בן גביר, הגיב להודעת היועצת המשפטית לממשלה על כתב אישום בכפוף לשימוע נגד נציב שב"ס. "גלי בהרב מיארה, ערב שימוע לפני דיון בוועדת שרים שתדון בהדחתה, ולאחר שבג"ץ גלגל אותה מכל המדרגות, מודיעה כי היא השלימה את תפירת התיק לנציב שב"ס קובי יעקובי, באמצעות מח"ש, המשטרה הפרטית והפוליטית שלה – וכי תגיש נגדו כתב אישום", אמר בתוקף.
"היועמ"שית מגישה את כתב האישום הפוליטי הזה מסיבה אחת", הצהיר בן גביר. "בניסיון להלך אימים על קצינים שמיישמים את מדיניות הדרג הנבחר, במטרה לבצע פוליטיזציה של מערכת אכיפת החוק, ולשמר את שלטון הדיפ סטייט".
השר לביטחון לאומי המשיך ואמר בתוקף כי הוא עומד מאחורי קובי יעקובי ומעניק לו גיבוי מלא: "אני מודיע באופן ברור ונחרץ: אני מעניק גיבוי מלא לרב-גונדר קובי יעקובי, שכמובן יישאר בתפקידו, וימשיך לבצעו כפי שהוא ביצע אותו עד עכשיו – בנחישות, במקצועיות, ללא משוא פנים, וכמובן ללא שום שיקולים זרים, למורת רוחה היועצת המשפטית לממשלה" והתנהגותה העבריינית".
יושב ראש מפלגת הדמוקרטים, אלוף (מיל') יאיר גולן, הגיב גם הוא להחלטה ותקף את בן גביר: "שר עבריין שמשחית את כל המערכת תחתיו. אנחנו נחליף אותם ונאכוף את שלטון החוק".