עיקר הונו של פדרר נבנה דרך שורת חוזי חסות עם מותגים יוקרתיים כמו רולקס (שעונים), לינדט (שוקולד) ועוד, שחלקם המשיכו גם לאחר פרישתו. ב-2018, לאחר סיום חוזהו עם נייקי, הוא חתם על הסכם חסות עם מותג הביגוד היפני יוניקלו בשווי של 300 מיליון דולר למשך 10 שנים – עסקה שהוזכרה בבלומברג כאחת מהחשובות בקריירה העסקית שלו.

פדרר, חובב נעליים מושבע, השקיע גם בחברת On Holding AG – מותג נעלי ספורט שוויצרי. הוא רכש שלושה אחוזים ממניות החברה, שכיום מוערכת בכ-14.5 מיליארד יורו. כלומר, שווי חלקו עומד על כ-430 מיליון.

במהלך שנותיו בטניס היו שלעגו לתדמיתו הצחה, אולי צחה מדי, של פדרר. אבל מסתבר שזה משתלם מאוד. "הוא חסין בפני שערוריות", אמר לבלומברג האנליסט בוב דורפמן. "הוא מעולם לא אמר דבר מטופש, אין לו את הסגנון הבועט של ג'ון מקנרו, אבל מבחינת ערך שיווקי – הוא מהגדולים אי פעם".